Ведущий разработчик Assassin's Creed Shadows уверяет игроков, что выбор одного главного героя не повлияет на их опыт. В игре участвуют два игровых персонажа: Naoe, женский шиноби и Ясуке, исторический африканский самурай-выбор, который вызвал обсуждение перед выпуском.
Возникла опасения, что сосредоточение внимания на одном персонаже может привести к отсутствию важных моментов сюжета или игрового процесса. Креативный директор Джонатан Дюмон рассмотрел эти проблемы, описывая свой собственный сбалансированный подход: он переключается между NAOE и Yasuke, посвящая примерно 3-5 часов на один, прежде чем переключиться на другое на 2-3 часа.
Тем не менее, Дюмон подчеркивает, что игроки не будут оштрафованы за предпочтение одного персонажа. В то время как у каждого главного героя есть уникальные начальные последовательности и личные сюжетные линии, повествование игры адаптируется к выбору игрока. Он призывает игроков играть за своего предпочтительного персонажа:
«Основной игровой процесс остается последовательным, независимо от вашего выбора. Вы не пропустите основные элементы сюжета. Речь идет о личных предпочтениях. Экспериментируйте и посмотрите, как игра приспосабливается к выбору вашего персонажа. У каждого есть свое собственное введение и квесты, но основная история адаптируется к вашему любимому герою».