O desenvolvedor principal da Assassin's Creed Shadows garante aos jogadores que a escolha de um único protagonista não afetará significativamente sua experiência. O jogo apresenta dois personagens jogáveis: Naoe, uma shinobi feminina e Yasuke, um samurai africano histórico-uma escolha que gerou discussão pré-lançamento.
Surgiram preocupações de que o foco em um personagem pode levar à falta de pontos cruciais da trama ou jogabilidade. O diretor criativo Jonathan Dumont abordou essas preocupações, descrevendo sua própria abordagem equilibrada: ele alterna entre Naoe e Yasuke, dedicando aproximadamente 3-5 horas a um antes de mudar para o outro por 2-3 horas.
No entanto, Dumont enfatiza que os jogadores não serão penalizados por favorecer um personagem. Enquanto cada protagonista tem sequências de abertura exclusivas e histórias pessoais, a narrativa do jogo se adapta à escolha do jogador. Ele incentiva os jogadores a interpretar como seu personagem preferido:
"A jogabilidade principal permanece consistente, independentemente de sua escolha. Você não perderá os principais elementos da trama. É realmente sobre preferência pessoal. Experimente e veja como o jogo se ajusta à seleção de seu personagem. Cada um tem sua própria introdução e missões, mas a história principal se adapta ao seu herói favorito".
