Le développeur principal d'Assassin's Creed Shadows assure aux joueurs que le choix d'un seul protagoniste n'aura pas d'impact significatif sur leur expérience. Le jeu présente deux personnages jouables: Naoe, une femme Shinobi, et Yasuke, un samouraï africain historique - un choix qui a généré une discussion pré-libérée.
Des inquiétudes se sont présentées que se concentrer sur un personnage pourrait conduire à manquer des points de tracé cruciaux ou un gameplay. Le directeur créatif Jonathan Dumont a répondu à ces préoccupations, décrivant sa propre approche équilibrée: il bascule entre Naoe et Yasuke, consacrant environ 3-5 heures à l'un avant de passer à l'autre pendant 2-3 heures.
Cependant, Dumont souligne que les joueurs ne seront pas pénalisés pour avoir favorisé un personnage. Alors que chaque protagoniste possède des séquences d'ouverture uniques et des scénarios personnels, le récit du jeu s'adapte au choix du joueur. Il encourage les joueurs à jouer comme personnage préféré:
"Le gameplay de base reste cohérent quel que soit votre choix. Vous ne manquerez pas les principaux éléments de l'intrigue. Il s'agit vraiment de préférence personnelle. Expérimentez et voyez comment le jeu s'adapte à la sélection de votre personnage. Chacun a sa propre introduction et ses quêtes, mais l'histoire principale s'adapte à votre héros préféré."
